Pupen (gemma)

- je základ budoucího rostlinného orgánu, tj. stonku, větve nebo listu. Většinou bývá kryt šupinami (tegmenta) - pokud není, nazývá se nahý. 

Ukázky pupenů a toho, co z nich vyrůstá:
Pupeny břízy bělokoré (Betula pendula):
Pupenyořešáku královského (Juglans regia):
Pupenmagnolie Soulangeovi (Magnolia x soulangeana):